El Palacio de la Merced, sede de la Diputación de Córdoba, es una de las localizaciones elegidas por la productora New Atlantis para rodar el documental histórico ‘Los archivos secretos de la Inquisición’, una coproducción hispano canadiense para televisión que verá la luz en 2005. Esta obra, dirigida por el canadiense David Rabinovitch, intenta arrojar luz sobre algunos de los episodios más singulares de la historia de la Inquisición española, idea que surge a raíz de la apertura de los archivos históricos de esta institución, permitida hace poco más de un año. El formato que adquirirá esta producción será el de una serie de cuatro capítulos, de una duración de 50 minutos cada uno aproximadamente, que además de tratar cuatro casos concretos de la Inquisición, intentará arrojar luz y tratar algunos de los aspectos más representativos de la vida y cultura de aquella época.
Con un presupuesto que supera los dos millones de euros, este documental contempla un plazo de rodaje y postproducción que ronda las ocho semanas, habiéndose desarrollado la grabación del mismo en otras ciudades y localidades españolas, como Madrid, Ciudad Real, Segovia, Cuenca y Talamanca del Jarama.